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🚀 功能特性

  • 多来源自动检索:自动从 PubMed/MedlinearXivmedRxivchemRxivbioRxiv 搜索并获取论文元数据与全文记录。项目主要聚焦于生物医学与计算交叉领域(Biomedicine + Computational Biology)。
  • 全文获取:支持自动从 PMC 下载开放获取的 XML/Text 全文。对于预印本及其他没有 PMC 全文的文献,集成了额外的获取模块以下载 原始 PDF,并将 Sci-Hub 作为兜底来源。
  • 结构化存储
    • 元数据:保存为结构清晰的详细 JSON 文件。
    • 全文:保存为多种格式,包括解析后的 JSON 和 Markdown,方便下游使用。其中 JSON 适合程序化分析,Markdown 更适合 LLM 理解与处理。
    • 标准化结构解析:所有文献都会被解析并组织为 标准化 JSON schema。该 schema 严格区分元数据字段(标题、年份、作者)和标准学术章节(abstract、introduction、results、discussion、methods、conclusion、supplementary、availability、funding、acknowledgements、author contributions、references、other)。同时支持 自定义章节解析,允许用户使用自定义 JSON schema 对具有特殊结构的文献进行语义解析。项目还提供了专门模块,用于从大批量主题相关论文中提取指定章节,并将其汇总为可溯源的 Markdown 文献语料,便于后续文献调研和系统综述写作。
  • LLM 与 Agent 增强:集成 LLM 技能和智能 Agent 能力,帮助用户串联文献调研与深度阅读的整个工作流。
  • CLI 工具:提供易用的命令行工具 paperflow,开箱即可完成所有核心操作。